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链特异性转录组测序（strand-specific RNA sequencing）是指在构建测序文库时，使用Illumina高保真Taq酶将mRNA链的偏向信息生涯到测序文库中。测序后的数据剖析可确定转录本是来自正义照旧反义DNA链。与通俗转录组测序相比，它更能准确地统计转录本的数目和确定基因的结构，同时可以发明更多的反义转录本，现在被普遍地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域规模。
应用偏向
1） 模式生物基因结构剖析：
模式生物已经有完整的基因注释信息，可是现实研究中保存个体差别性。使用链特异性转录组测序可以对个体表达基因的结构举行深度剖析，对基因举行重注释。
2） 差别基因准确剖析：
能针对差别转录偏向的基因举行表达量统计及差别表达剖析，从而推断出与功效状态转变相关联的候选基因，展现差别基因的功效分类和相关代谢通路。
3） 原核生物使用子剖析：
对原核生物的链特异性转录组剖析，能越发准确地举行使用子判断和剖析。
手艺优势:
1） 准确度高：文库制备和测序历程中保存了RNA偏向信息，有用数据增多，从而使基因表达定量越发准确。与基因组和参考基因组的比对效果，其链特异的效果均相近或稍高于非特异性效果。
2） 富厚度高：准确发明反义转录本，获取更多转录内情关信息，举行判断剖析。
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